Світ мікроРНК гепатобіліарної системи

##plugins.themes.bootstrap3.article.sidebar##

PDF
Опубліковано: Apr 6, 2021
DOI: https://doi.org/10.22141/2224-0551.16.1.2021.226462
Ключові слова:
геном, мікроРНК, методи детекції, гепатобіліарна система, огляд

##plugins.themes.bootstrap3.article.main##

A.E. Abaturov
ДЗ «Дніпропетровська медична академія Міністерства охорони здоров’я України», м. Дніпро, Україна
https://orcid.org/0000-0001-6291-5386
V.L. Babуch
ДЗ «Дніпропетровська медична академія Міністерства охорони здоров’я України», м. Дніпро, Україна
https://orcid.org/0000-0001-9261-9051

Анотація

У науковому огляді наведений світ мікроРНК гепатобіліарної системи. Для написання статті здійснювався пошук інформації з використанням баз даних Scopus, Web of Science, MedLine, PubMed, Google Scholar, EMBASE, Global Health, The Cochrane Library, CyberLeninka. Було підкреслено, що мікроРНК у клітинах відіграють важливу роль у регуляції активності експресії генів і контролюють численні фізіологічні процеси, такі як обмін речовин, проліферація, диференціювання, апоптоз клітин. Відображена асоціація деяких захворювань зі зміною вмісту мікроРНК у периферійному руслі крові. У статті наведена коротка характеристика групи некодуючих РНК. Надана характеристика основних баз даних мікроРНК із відображенням електронних адрес. Для визначення мікроРНК використовують як традиційні методи, засновані на технології ампліфікації, так і нові методи детекції (секвенування нового покоління, електрохімічне детектування на основі посилення ферментатного сигналу, ідентифікація за допомогою лігування і застосування золотих наночастинок). Автори проводять порівняння різних методів детекції мікроРНК. Зазначено, що надекспресія або інгібування генерації специфічних мікроРНК супроводжуються порушеннями найважливіших функцій печінки і розвитком захворювань гепатобіліарної системи. Продемонстровано, що зміни деяких мікроРНК у сироватці крові або тканині печінки є високодіагностичними маркерами деяких захворювань печінки. Таким чином, ідентифікація зміни рівня презентабельності певних мікроРНК може дати цінну діагностичну інформацію практикуючому лікарю, а вплив на процеси утворення та матурації мікроРНК за допомогою лікарських засобів становить собою новий напрямок терапії широкого спектра захворювань. Особливий інтерес викликає сучасне уявлення про діагностичне значення мікроРНК при захворюваннях біліарного тракту в дітей та можливості медикаментозного управління активністю процесу їх генерації.

##plugins.themes.bootstrap3.article.details##

Як цитувати
Abaturov, A., і Babуch V. «Світ мікроРНК гепатобіліарної системи». Здоров’я дитини - Zdorovʹe Rebenka, вип. 16, вип. 1, Квітень 2021, с. 84-93, doi:10.22141/2224-0551.16.1.2021.226462.
Номер
Том 16 № 1 (2021)
Розділ
Огляд літератури
Creative Commons License

Ця робота ліцензується відповідно до Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Наше видання використовує положення про авторські права CreativeCommons для журналів відкритого доступу.

Автори, які публікуються в цьому журналі, погоджуються з наступними умовами:

  1. Автори зберігають за собою права на авторство своєї роботи і надають журналу право першої публікації цієї роботи на умовах ліцензії Creative Commons Attribution 4.0 International License, яка дозволяє іншим особам вільно поширювати опубліковану роботу з обов'язковим посиланням на авторів оригінальної роботи та оригінальну публікацію в цьому журналі.
  2. Автори, направляючи до редакції (видавця) матеріал для публікації, погоджуються з тим, що редакції (видавцю) передаються права на захист та використання даного матеріалу, в тому числі такі охоронювані об'єкти авторського права, як фотографії автора, малюнки, схеми, таблиці тощо, у тому числі на відтворення в пресі та в мережі Інтернет; на поширення; на переклад рукопису на будь-які мови; експорт та імпорт примірників видання зі статтею авторів з метою поширення, доведення до загального відома.
  3. Зазначені вище права автори передають редакції (видавцю) без обмеження терміну їх дії та на території всіх країн світу.
  4. Автори гарантують наявність у них виключних прав на використання переданої редакції  (видавцю) матеріалу. Редакція (видавець) не несе відповідальності перед третіми особами за порушення даних авторами гарантій.
  5. Автори зберігають право укладати окремі угоди на неексклюзивне поширення роботи в тому вигляді, в якому вона була опублікована цим журналом (наприклад, розміщувати роботу в електронному архіві установи або публікувати в складі монографії), з умовою збереження посилання на оригінальну публікацію в цьому журналі.
  6. Політика журналу дозволяє і заохочує розміщення авторами в мережі Інтернет (наприклад в інститутському сховищі або на персональному сайті) рукописи опублікованої роботи, так як це сприяє продуктивної наукової дискусії і позитивно позначається на оперативності та динаміці цитування статті.
  7. Права на статтю вважаються переданими авторами редакції (видавцю) з моменту публікації матеріалу друкованої або електронної версії видання. Перепублікація матеріалу, опублікованого у виданні, іншими фізичними та юридичними особами можливе лише з дозволу редакції (видавця), з обов'язковим зазначенням повного бібліографічного посилання.

Посилання

Abaturov OE, Babych VL. The role of microRNA in diseases of the biliary system. Zdorov`e rebenka. 2017;12(7):155-161. doi:10.22141/2224-0551.12.7.2017.116191. (in Ukrainian).

Fedyanin MYu, Ignatova EO, Tyulyandin SA. The role of microRNAs in solid tumors. Zlokačestvennye opuholi. 2013;(1):3-14. (in Russian).

Ambros V. The functions of animal microRNAs. Nature. 2004 Sep 16;431(7006):350-355. doi:10.1038/nature02871.

Backes C, Meder B, Hart M, et al. Prioritizing and selecting likely novel miRNAs from NGS data. Nucleic Acids Res. 2016 Apr 7;44(6):e53. doi:10.1093/nar/gkv1335.

Bartel DP. Metazoan MicroRNAs. Cell. 2018 Mar 22;173(1):20-51. doi:10.1016/j.cell.2018.03.006.

Bertoli G, Cava C, Castiglioni I. MicroRNAs: New Biomarkers for Diagnosis, Prognosis, Therapy Prediction and Therapeutic Tools for Breast Cancer. Theranostics. 2015 Jul 13;5(10):1122-1143. doi:10.7150/thno.11543.

Budak H, Bulut R, Kantar M, Alptekin B. MicroRNA nomenclature and the need for a revised naming prescription. Brief Funct Genomics. 2016 Jan;15(1):65-71. doi:10.1093/bfgp/elv026.

Cammaerts S, Strazisar M, De Rijk P, Del Favero J. Genetic variants in microRNA genes: impact on microRNA expression, function, and disease. Front Genet. 2015 May 21;6:186. doi:10.3389/fgene.2015.00186.

Cao B, Zhou X, Ma J, et al. Role of MiRNAs in Inflammatory Bowel Disease. Dig Dis Sci. 2017 Jun;62(6):1426-1438. doi:10.1007/s10620-017-4567-1.

Cao Y, Fanning S, Proos S, Jordan K, Srikumar S. A Review on the Applications of Next Generation Sequencing Technologies as Applied to Food-Related Microbiome Studies. Front Microbiol. 2017 Sep 21;8:1829. doi:10.3389/fmicb.2017.01829.

Cech TR, Steitz JA. The noncoding RNA revolution-trashing old rules to forge new ones. Cell. 2014 Mar 27;157(1):77-94. doi:10.1016/j.cell.2014.03.008.

Chen J, Hu C, Pan P. Extracellular Vesicle MicroRNA Transfer in Lung Diseases. Front Physiol. 2017 Dec 12;8:1028. doi:10.3389/fphys.2017.01028.

Crawford NP. Deciphering the Dark Matter of Complex Genetic Inheritance. Cell Syst. 2016 Mar 23;2(3):144-146. doi:10.1016/j.cels.2016.03.003.

Delihas N. Discovery and characterization of the first non-coding RNA that regulates gene expression, micF RNA: A historical perspective. World J Biol Chem. 2015 Nov 26;6(4):272-280. doi:10.4331/wjbc.v6.i4.272.

Dweep H, Gretz N. miRWalk2.0: a comprehensive atlas of microRNA-target interactions. Nat Methods. 2015 Aug;12(8):697. doi:10.1038/nmeth.3485.

ENCODE Project Consortium. An integrated encyclopedia of DNA elements in the human genome. Nature. 2012 Sep 6;489(7414):57-74. doi:10.1038/nature11247.

Filipowicz W, Bhattacharyya SN, Sonenberg N. Mechanisms of post-transcriptional regulation by microRNAs: are the answers in sight? Nat Rev Genet. 2008 Feb;9(2):102-14. doi:10.1038/nrg2290.

Finch ML, Marquardt JU, Yeoh GC, Callus BA. Regulation of microRNAs and their role in liver development, regeneration and disease. Int J Biochem Cell Biol. 2014 Sep;54:288-303. doi:10.1016/j.biocel.2014.04.002.

Iacomino G, Siani A. Role of microRNAs in obesity and obesity-related diseases. Genes Nutr. 2017 Sep 25;12:23. doi:10.1186/s12263-017-0577-z.

Ichii O, Horino T. MicroRNAs associated with the development of kidney diseases in humans and animals. J Toxicol Pathol. 2018 Jan;31(1):23-34. doi:10.1293/tox.2017-0051.

Jeon TI, Osborne TF. miRNA and cholesterol homeostasis. Biochim Biophys Acta. 2016 Dec;1861(12 Pt B):2041-2046. doi:10.1016/j.bbalip.2016.01.005.

Lee R, Feinbaum R, Ambros V. A short history of a short RNA. Cell. 2004 Jan 23;116(2 Suppl):S89-92, 1 p following S96. doi:10.1016/s0092-8674(04)00035-2.

Lee RC, Feinbaum RL, Ambros V. The C. elegans heterochronic gene lin-4 encodes small RNAs with antisense complementarity to lin-14. Cell. 1993 Dec 3;75(5):843-854. doi:10.1016/0092-8674(93)90529-y.

Letelier P, Riquelme I, Hernández AH, Guzmán N, Farías JG, Roa JC. Circulating MicroRNAs as Biomarkers in Biliary Tract Cancers. Int J Mol Sci. 2016 May 23;17(5):791. doi:10.3390/ijms17050791.

Liu K, Tong H, Li T, Wang X, Chen Y. Research progress in molecular biology related quantitative methods of MicroRNA. Am J Transl Res. 2020 Jul 15;12(7):3198-3211.

Londin E, Loher P, Telonis AG, et al. Analysis of 13 cell types reveals evidence for the expression of numerous novel primate- and tissue-specific microRNAs. Proc Natl Acad Sci U S A. 2015 Mar 10;112(10):E1106-1115. doi:10.1073/pnas.1420955112.

Marian AJ, van Rooij E, Roberts R. Genetics and Genomics of Single-Gene Cardiovascular Diseases: Common Hereditary Cardiomyopathies as Prototypes of Single-Gene Disorders. J Am Coll Cardiol. 2016 Dec 27;68(25):2831-2849. doi:10.1016/j.jacc.2016.09.968.

McCall MN, Kim MS, Adil M, et al. Toward the human cellular microRNAome. Genome Res. 2017 Oct;27(10):1769-1781. doi:10.1101/gr.222067.117.

McGeary SE, Lin KS, Shi CY, et al. The biochemical basis of microRNA targeting efficacy. Science. 2019 Dec 20;366(6472):eaav1741. doi:10.1126/science.aav1741.

Mellis D, Caporali A. MicroRNA-based therapeutics in cardiovascular disease: screening and delivery to the target. Biochem Soc Trans. 2018 Feb 19;46(1):11-21. doi:10.1042/BST20170037.

Meyts I, Bosch B, Bolze A, et al. Exome and genome sequencing for inborn errors of immunity. J Allergy Clin Immunol. 2016 Oct;138(4):957-969. doi:10.1016/j.jaci.2016.08.003.

Minatel BC, Martinez VD, Ng KW, et al. Large-scale discovery of previously undetected microRNAs specific to human liver. Hum Genomics. 2018 Mar 27;12(1):16. doi:10.1186/s40246-018-0148-4.

Mingardi J, Musazzi L, De Petro G, Barbon A. miRNA Editing: New Insights into the Fast Control of Gene Expression in Health and Disease. Mol Neurobiol. 2018 Oct;55(10):7717-7727. doi:10.1007/s12035-018-0951-x.

Mitchell PS, Parkin RK, Kroh EM, et al. Circulating microRNAs as stable blood-based markers for cancer detection. Proc Natl Acad Sci U S A. 2008 Jul 29;105(30):10513-10518. doi:10.1073/pnas.0804549105.

Panzeri I, Rossetti G, Abrignani S, Pagani M. Long Intergenic Non-Coding RNAs: Novel Drivers of Human Lymphocyte Differentiation. Front Immunol. 2015 Apr 15;6:175. doi:10.3389/fimmu.2015.00175.

Papanagnou P, Stivarou T, Tsironi M. The Role of miRNAs in Common Inflammatory Arthropathies: Osteoarthritis and Gouty Arthritis. Biomolecules. 2016 Nov 11;6(4):44. doi:10.3390/biom6040044.

Picard C, Fischer A. Contribution of high-throughput DNA sequencing to the study of primary immunodeficiencies. Eur J Immunol. 2014 Oct;44(10):2854-2861. doi:10.1002/eji.201444669.

Piriyapongsa J, Bootchai C, Ngamphiw C, Tongsima S. microPIR2: a comprehensive database for human-mouse comparative study of microRNA-promoter interactions. Database (Oxford). 2014 Nov 25;2014:bau115. doi:10.1093/database/bau115.

Ramassone A, Pagotto S, Veronese A, Visone R. Epigenetics and MicroRNAs in Cancer. Int J Mol Sci. 2018 Feb 3;19(2):459. doi:10.3390/ijms19020459.

Seleman M, Hoyos-Bachiloglu R, Geha RS, Chou J. Uses of Next-Generation Sequencing Technologies for the Diagnosis of Primary Immunodeficiencies. Front Immunol. 2017 Jul 24;8:847. doi:10.3389/fimmu.2017.00847.

Siggens L, Ekwall K. Epigenetics, chromatin and genome organization: recent advances from the ENCODE project. J Intern Med. 2014 Sep;276(3):201-214. doi:10.1111/joim.12231.

Signal B, Gloss BS, Dinger ME. Computational Approaches for Functional Prediction and Characterisation of Long Noncoding RNAs. Trends Genet. 2016 Oct;32(10):620-637. doi:10.1016/j.tig.2016.08.004.

Takata A, Otsuka M, Yoshikawa T, Kishikawa T, Ohno M, Koike K. MicroRNAs and liver function. Minerva Gastroenterol Dietol. 2013 Jun;59(2):187-203.

Turchinovich A, Weiz L, Langheinz A, Burwinkel B. Characterization of extracellular circulating microRNA. Nucleic Acids Res. 2011 Sep 1;39(16):7223-7233. doi:10.1093/nar/gkr254.

Valinezhad Orang A, Safaralizadeh R, Kazemzadeh-Bavili M. Mechanisms of miRNA-Mediated Gene Regulation from Common Downregulation to mRNA-Specific Upregulation. Int J Genomics. 2014;2014:970607. doi:10.1155/2014/970607.

Wang X, He Y, Mackowiak B, Gao B. MicroRNAs as regulators, biomarkers and therapeutic targets in liver diseases. Gut. 2020 Oct 30:gutjnl-2020-322526. doi:10.1136/gutjnl-2020-322526.

Wang Y, Xu D, Wang B, Hou X. Could MicroRNAs be Regulators of Gout Pathogenesis? Cell Physiol Biochem. 2015;36(6):2085-2092. doi:10.1159/000430176.

Wasik U, Kempinska-Podhorodecka A, Bogdanos DP, Milkiewicz P, Milkiewicz M. Enhanced expression of miR-21 and miR-150 is a feature of anti-mitochondrial antibody-negative primary biliary cholangitis. Mol Med. 2020 Jan 16;26(1):8. doi:10.1186/s10020-019-0130-1.

Weber JA, Baxter DH, Zhang S, et al. The microRNA spectrum in 12 body fluids. Clin Chem. 2010 Nov;56(11):1733-1741. doi:10.1373/clinchem.2010.147405.

Willeit P, Skroblin P, Kiechl S, Fernández-Hernando C, Mayr M. Liver microRNAs: potential mediators and biomarkers for metabolic and cardiovascular disease? Eur Heart J. 2016 Nov 14;37(43):3260-3266. doi:10.1093/eurheartj/ehw146.

Yin X, Chai Z, Sun X, et al. Overexpression of microRNA-96 is associated with poor prognosis and promotes proliferation, migration and invasion in cholangiocarcinoma cells via MTSS1. Exp Ther Med. 2020 Apr;19(4):2757-2765. doi:10.3892/etm.2020.8502.

Zhang T, Yang Z, Kusumanchi P, Han S, Liangpunsakul S. Critical Role of microRNA-21 in the Pathogenesis of Liver Diseases. Front Med (Lausanne). 2020 Jan 31;7:7. doi:10.3389/fmed.2020.00007.