DOI: https://doi.org/10.15587/2313-8416.2015.54039

Генетичний поліморфізм плідників стерляді (acipenser ruthenus) за мікросателітними ДНК-маркерами

Ольга Олексіївна Малишева, Христина Миколаївна Курта, Любов Іванівна Калакайло, Лариса Миколаївна Шинкаренко, Владислав Геннадійович Спиридонов

Аннотация


На основі мікросателітного аналізу ДНК за трьома маркерами (LS-19, LS-68 та LS-39) розглянуто внутрішньовидову генетичну структуру плідників стерляді. В результаті проведених робіт було встановлено, що за показниками генетичного поліморфізму дана група риб знаходиться у збалансованому стані. На основі визначених індивідуальних відмінностей в алельних варіантах здійснено підбір і комбінування батьківських пар за альтернативними генотипами. Результати проведених досліджень дозволяють оптимізувати подальші роботи з відтворення осетрових видів риб в умовах штучного вирощування


Ключевые слова


осетрові види риб; стерлядь; аквакультура; плідники; мікросателітні ДНК-маркери; локус; алель; генотип; поліморфізм; підбір батьківських пар

Полный текст:

PDF (Українська)

Литература


Chelomina, G. N., Rozhkovan, K. V., Ivanov, S. A. (2008). Diskriminatsiya mezhvidovykh gibridov v prirodnykh populyatsiyakh osetrovykh ryb amura s pomoshch'yu mul'tilokusnykh rapd_pcr markerov. Tsitologiya i genetika, 5, 61–71.

Barannikova, I. A., Nikonorov, S. I., Belousov, A. N. (2000). Problema sokhraneniya osetrovykh v sovremennyy period. Osetrovye na rubezhe KhKhІ veka. Astrakhan', 7–9.

Tretjak, O. M., Ghankevych, B. O., Kolos, O. M., Jakovljeva, T. V. (2010). Stan zapasiv osetrovykh ryb ta rozvytok osetrovoji akvakuljtury v Ukrajini. Ryboghospodarsjka nauka Ukrajiny, 4, 4–22.

Malysheva, O. O., Spyrydonov, V. Gh., Meljnychuk, S. D. (2014). Ghenetychna struktura populjaciji sterljadi (Acipenser ruthenus) za mikrosatelitnymy markeramy DNK. Visnyk sumsjkogho nacionaljnogho aghrarnogho universytetu: Serija «Tvarynnyctvo», 2/1 (24), 212–215.

Malysheva, O. O., Spyrydonov, V. Gh., Meljnychuk, S. D., Kurta, Kh. M. (2014). Vykorystannja mikrosatelitnykh DNK-markeriv dlja pidboru ta kombinuvannja par plidnykiv sterljadi ta bestera. Naukovo-tekhnichnyj bjuletenj Instytutu Biologhiji tvaryn i DMDKI vetpreparativ ta kormovykh dobavok, 15 (2, 3), 245–251.

Barmintseva, A. E., Myuge, N. S. (2013). Ispol'zovanie mikrosatellitnykh lokusov dlya ustanovleniya vidovoy prinadlezhnosti osetrovykh (Acipenseridae) i vyyavleniya osobey gibridnogo proiskhozhdeniya. Genetika zhivotnykh, 49 (9), 1093–1105.

Lesyuk, M. I., Koneva, O. Yu., Rovba, E. A., Slukvin, A. M. (2012). Molekulyarno-geneticheskie issledovaniya proizvoditeley sterlyadi. Molekulyarnaya i prikladnaya genetika, 13, 110–117.

Dudu, A. A., Georgescu, S. E., Burcea, A. Florencu, I., Costahe, M. (2013). Microsatelittes Variation in Sterlet Sturgeon, Acipenser Ruthenus from the Lower Danube . Animal Science and Biotechnologies, 46 (1), 90–94.

Kozlova, N. V., Bazelyuk, N. N., Fayzulina, D. R., Stonogina, E. V. (2013). Primenenie molekulyarno-geneticheskikh issledovaniy v akvakul'ture osetrovykh ryb. Vestnik AGTU. Seriya: Rybnoe khazyaystvo, 3, 113–117.

Slukvin, A. M., Koneva, O. Yu., Lesyuk, M. I. (2009). Rezul'taty populyatsionnoy identifikatsii proizvoditeley sterlyadi (Acipenser ruthenus) OAO «Rybkhoz»Poles'e» (Brestskaya oblast', Belarus'), poluchennye s pomoshch'yu mikrosatellitnogo analiza DNK. Pervaya konferentsiya molodykh uchenykh NACEE. Voprosy akvakul'tury, 46–47.

May, B., Krueger, C. C., Kincaid, H. L. (1997). Genetic variation at microsatellite loci in sturgeon: primer sequence homology in Acipenser and Scaphirhynchus. Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences, 54 (7), 1542–1547. doi: 10.1139/cjfas-54-7-1542

Boom, R., Sol, C., Salimans, M. et. al. (1990). Rapid and Simple Method for Purification of Nucleic Acids. Journal of clinical microbiology, 28, 495–503.

Rjeznykova-Ghalashevych, I. S., Stepura, V. V., Sheljov, A. V., Spyrydonov, V. Gh., Tabaka, P. P., Meljnychuk, S. D., Alymov, S. I. (2011). Ghenetychna identyfikacija promyslovykh vydiv ryb. Kyiv: Vydavnychyj centr NUBiP Ukrajiny, 35.

Kalinowski, S. T., Taper, M. L., Marshall, T. C. (2007). Revising how the computer program cervus accommodates genotyping error increases success in paternity assignment. Molecular Ecology, 16 (5), 1099–1106. doi: 10.1111/j.1365-294x.2007.03089.x

Marshall, T. C., Slate, J., Kruuk, L. E. B., Pemberton, J. M. (1998). Statistical confidence for likelihood-based paternity inference in natural populations. Molecular Ecology, 7 (5), 639–655. doi: 10.1046/j.1365-294x.1998.00374.x


Пристатейная библиография ГОСТ


1. Челомина, Г. Н. Дискриминация межвидовых гибридов в природных популяциях осетровых рыб амура с помощью мультилокусных rapd_pcr маркеров [Текст] / Г. Н. Челомина, К. В. Рожкован, С. А. Иванов // Цитология и генетика. – 2008. – № 5. – С. 61–71.

2. Баранникова, И. А. Проблема сохранения осетровых в современный период [Текст]: тезисы докладов междунар. конф. / И. А. Баранникова, С. И. Никоноров, А. Н. Белоусов // Осетровые на рубеже ХХІ века. – Астрахань, 2000. – С. 7–9.

3. Третяк, О. М. Стан запасів осетрових риб та розвиток осетрової аквакультури в Україні [Текст] / О. М. Третяк, Б. О. Ганкевич, О. М. Колос, Т. В. Яковлєва // Рибогосподарська наука України. – 2010. – № 4. – С. 4–22.

4. Малишева, О. О. Генетична структура популяції стерляді (Acipenser ruthenus) за мікросателітними маркерами ДНК [Текст] / О. О. Малишева, В. Г. Спиридонов, С. Д. Мельничук // Вісник сумського національного аграрного університету: Серія «Тваринництво». – 2014. – Вип. 2/1 (24). – С. 212–215.

5. Малишева, О. О. Використання мікросателітних ДНК-маркерів для підбору та комбінування пар плідників стерляді та бестера [Текст] / О. О. Малишева, В. Г. Спиридонов, С. Д. Мельничук, Х. М. Курта // Науково-технічний бюлетень Інституту Біології тварин і ДМДКІ ветпрепаратів та кормових добавок. – 2014. – Вип. 15, № 2, 3. – С. 245–251.

6. Барминцева, А. Е. Использование микросателлитных локусов для установления видовой принадлежности осетровых (Acipenseridae) и выявления особей гибридного происхождения [Текст] / А. Е. Барминцева, Н. С. Мюге // Генетика животных. – 2013. – Т. 49, № 9. – С. 1093–1105.

7. Лесюк, М. И. Молекулярно-генетические исследования производителей стерляди [Текст] / М. И. Лесюк, О. Ю. Конева, Е. А. Ровба, А. М. Слуквин // Молекулярная и прикладная генетика. – 2012. – Т. 13. – С. 110–117.

8. Dudu, A. A. Microsatelittes Variation in Sterlet Sturgeon, Acipenser Ruthenus from the Lower Danube [Text] / A. A. Dudu, S. E. Georgescu, A. Burcea, I. Florencu, M. Costahe // Animal Science and Biotechnologies. – 2013. – Vol. 46, Issue 1. – P. 90–94.

9. Козлова, Н. В. Применение молекулярно-генетических исследований в аквакультуре осетровых рыб [Текст] / Н. В. Козлова, Н. Н. Базелюк, Д. Р. Файзулина, Е. В. Стоногина // Вестник АГТУ. Серия: Рыбное хазяйство. – 2013. – № 3. – С. 113–117.

10. Слуквин, А. М. Результаты популяционной идентификации производителей стерляди (Acipenser ruthenus) ОАО «Рыбхоз»Полесье» (Брестская область, Беларусь), полученные с помощью микросателлитного анализа ДНК [Текст] / А. М. Слуквин, О. Ю. Конева, М. И. Лесюк // Первая конференция молодых ученых NACEE. Вопросы аквакультуры. – 2009. – С. 46–47

11. May, B. Genetic variability at microsatellite loci in sturgeon: primer sequence homology in Acipenser and Scaphirinchus [Text] / B. May, C.C. Krueger, H.L. Kincaid // Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences. – 1997. – Vol. 54, Issue 7. – P. 1542–1547. doi: 10.1139/cjfas-54-7-1542

12. Boom, R. Rapid and Simple Method for Purification of Nucleic Acids [Text] / R. Boom, C. Sol, M. Salimans et. al. //Journal of clinical microbiology. – 1990. – Vol. 28. – P. 495–503.

13.  Рєзникова-Галашевич, І. С. Генетична ідентифікація промислових видів риб [Текст] / І. С. Рєзникова-Галашевич, В. В. Степура, А. В. Шельов, В. Г. Спиридонов, П. П. Табака, С. Д. Мельничук, С. І. Алимов // Методичні рекомендації. – К.: Видавничий центр НУБіП України, 2011. – 35 с.

14. Kalinowski, S. T. Revising how the computer program CERVUS accommodates genotyping error increases success in paternity assignment [Text] / S. T. Kalinowski, M. L. Taper, T. C. Marshall // Molecular Ecology. – 2007. – Vol. 16, Issue 5. – P. 1099–1106. doi: 10.1111/j.1365-294x.2007.03089.x

15. Marshall, T. C. Statistical confidence for likelihood-based paternity inference in natural populations [Text] / T. C. Marshall, J. Slate, L. E. B. Kruuk, J. M. Pemberton // Molecular Ecology. – 1998. – Vo. 7, Issue 5. – P. 639–655. doi: 10.1046/j.1365-294x.1998.00374.x







Copyright (c) 2015 Ольга Олексіївна Малишева, Христина Миколаївна Курта, Любов Іванівна Калакайло, Лариса Миколаївна Шинкаренко, Владислав Геннадійович Спиридонов

Creative Commons License
Эта работа лицензирована Creative Commons Attribution 4.0 International License.

ISSN 2313-8416 (Online), ISSN 2313-6286 (Print)