Генетические варианты микобактерий туберкулеза и их эпидемиологическая значимость
DOI:
https://doi.org/10.15587/2313-8416.2015.38954Ключові слова:
микобактерии туберкулеза, генотипы, эпидемиология, Beijing, LA-M, Haarlem, распространенность, клинические особенностиАнотація
С помощью основных молекулярно-биологических методов можно проводить типирование M. tuberculosis. Обнаружено более 2000 различных генотипов, некоторые из них распространены повсеместно, другие встречаются реже или характерны для какого-то конкретного региона. Так, наиболее распространенным генотипом является Beijing, несколько реже встречается LA-M и Haarlem. С генотипом Beijing часто связывают неблагоприятное течение туберкулеза и более частое обнаружение устойчивости к противотуберкулезным препаратам
Посилання
Balasajanc, G. S., Grejmer, M. S. (2003). Osobennosti vozbuditelja pri ostro progressirujushhej tuberkuleze legkih. Problemy tuberkuleza i boleznej legkih, 9, 29–31.
Roetzer, A., Diel, R., Kohl, T. A., Rückert, C., Nübel, U., Blom, J. et. al. (2013). Whole Genome Sequencing versus Traditional Genotyping for Investigation of a Mycobacterium tuberculosis Outbreak: A Longitudinal Molecular Epidemiological Study. PLoS Medicine, 10 (2), e1001387. doi: 10.1371/journal.pmed.1001387
Shemjakin, I. G., Stepanshina, V. N., Manzenjuk, O. Ju. et. al. (2000). Ispol'zovanie molekuljarno-biologicheskih metodov dlja individual'noj harakteristiki shtammov M.tuberculosis. Zhurn. mikrobiol., 2, 6–11.
Demay, C., Liens, B., Burguière, T., Hill, V., Couvin, D., Millet, J. et. al. (2012). SITVITWEB – A publicly available international multimarker database for studying Mycobacterium tuberculosis genetic diversity and molecular epidemiology. Infection, Genetics and Evolution, 12 (4), 755–766. doi: 10.1016/j.meegid.2012.02.004
Matrakshin, A. G., Mes'ko, E. M., Beljakova, E. K. et. al. (2004). Genotipicheskaja harakteristika shtammov Mycobacterium tuberculosis iz respubliki Tyva. Problemy tuberkuleza, 3, 37–40.
Garcia de Viedma, D., Bouza, E., Rastogi, N., & Sola, C. (2005). Analysis of Mycobacterium tuberculosis Genotypes in Madrid and Identification of Two New Families Specific to Spain-Related Settings. Journal of Clinical Microbiology, 43 (4), 1797–1806. doi: 10.1128/jcm.43.4.1797-1806.2005
Van Soolingen, D., Qian, L., de Haas, P. E. et al. (1995). Predominance of a single genotype of Mycobacterium tuberculosis in countries of east Asia. J Clin Microbiol., 33 (9), 3234–3238.
Bifani, P. J., Mathema, B., Kurepina, N. E., Kreiswirth, B. N. (2002). Global dissemination of the Mycobacterium tuberculosis W-Beijing family strains. Trends in Microbiology, 10 (1), 45–52. doi: 10.1016/s0966-842x(01)02277-6
Mokrousov, I., Narvskaya, O., Otten, T., Vyazovaya, A., Limeschenko, E., Steklova, L., Vyshnevskyi, B. (2002). Phylogenetic reconstruction within Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype in northwestern Russia. Research in Microbiology, 153 (10), 629–637. doi: 10.1016/s0923-2508(02)01374-8
Kremer, K., Glynn, J. R., Lillebaek, T., Niemann, S., Kurepina, N. E., Kreiswirth, B. N. et. al. (2004). Definition of the Beijing/W Lineage of Mycobacterium tuberculosis on the Basis of Genetic Markers. Journal of Clinical Microbiology, 42 (9), 4040–4049. doi: 10.1128/jcm.42.9.4040-4049.2004
Krut'ko, V. S., Fіlіpenko, M. L., Ljashenko, O. O. et. al. (2005). Rezul'tati genotipuvannja shtamіv Mycobacterium tuberculosis u hvorih na tuberkul'oz legen' m. Harkova. Vіsnik naukovih doslіdzhen', 40 (3), 17–18.
Bifani, P. J. (1996). Origin and interstate spread of a New York City multidrug-resistant Mycobacterium tuberculosis clone family. JAMA: The Journal of the American Medical Association, 275 (6), 452–457. doi: 10.1001/jama.275.6.452
Chernousova, L. N., Pospelov, L. E., Matrakshin, A. G. et. al. (2004). Genotipicheskaja harakteristika shtammov Mycobacterium tuberculosis iz respubliki Tyva. Problemy tuberkuleza i boleznej legkih, 3, 37–40.
Garcia de Viedma, D., Bouza, E., Rastogi, N., Sola, C. (2005). Analysis of Mycobacterium tuberculosis Genotypes in Madrid and Identification of Two New Families Specific to Spain-Related Settings. Journal of Clinical Microbiology, 43 (4), 1797–1806. doi: 10.1128/jcm.43.4.1797-1806.2005
Pheiffer, C., Betts, J. C., Flynn, H. R. et al. (2005). Protein expression by a Beijing strain differs from that of another clinical isolate and Mycobacterium tuberculosis H37Rv. Microbiology, 151 (4), 1139–1150. doi: 10.1099/mic.0.27518-0
Filliol, I., Driscoll, J. R., van Soolingen, D., Kreiswirth, B. N., Kremer, K., Valétudie, G. et. al. (2002). Global Distribution of Mycobacterium tuberculosis Spoligotypes. Emerging Infectious Diseases, 8 (11), 1347–1349. doi: 10.3201/eid0811.020125
Cole, S. T. (2002). Comparative mycobacterial genomics as a tool for drug target and antigen discovery. European Respiratory Journal, 20 (36), 78–86. doi: 10.1183/09031936.02.00400202
Milan, S. J., Hauge, K. A., Kurepina, N. E., Lofy, K. H., Goldberg, S. V., Narita, M. et. al. (2004). Expanded Geographical Distribution of the N Family of Mycobacterium tuberculosis Strains within the United States. Journal of Clinical Microbiology, 42 (3), 1064–1068. doi: 10.1128/jcm.42.3.1064-1068.2004
Dymova, M. A., Kushugulova, A. R., Rahimova, S. E. et. al. (2011). Molekuljarno-geneticheskaja harakteristika izoljatov M.tuberculosis u bol'nyh tuberkulezom legkih g. Astana. Bjulleten' SO RAMN, 31 (1), 107–112.
Fedorin, I. M., Nikolaevskij, V. V., Balabanova, Ja. M. et. al. (2005). Molekuljarnoe genotipirovanie shtammov Mycobacterium tuberculosis, cirkulirujushhih v Central'noj Rossii: jeffektivnost' spoligotipirovanija i VNTR-MIRU. Molekuljarnaja genetika ,mikrobiologija i virusologija, 4, 9–14.
Skornjakov, S. N., Umpeleva, T. V., Vjazovaja, A. A. et. al. (2014). Genotipirovanie ural'skih izoljatov Mycobacterium tuberculosis. Biologicheskie nauki, 11 (9), 2485–2488.
Antonenko, P. B., Kresjun, V. I., Filjuk, V. V. et. al. (2014). Covremennoe sostojanie medikamentoznoj rezistentnosti vozbuditelja tuberkuleza i vozmozhnosti ego genotipicheskogo opredelenija. Klinicheskaja medicina, 43 (3), 8–13.
Weisenberg, S. A., Gibson, A. L., Huard, R. C., Kurepina, N., Bang, H., Lazzarini, L. C. O. et. al. (2012). Distinct clinical and epidemiological features of tuberculosis in New York City caused by the RDRio Mycobacterium tuberculosis sublineage. Infection, Genetics and Evolution, 12 (4), 664–670. doi: 10.1016/j.meegid.2011.07.018
Liu, Y., Tian, M., Wang, X., Wei, R., Xing, Q., Ma, T. et. al. (2014). Genotypic Diversity Analysis of Mycobacterium tuberculosis Strains Collected from Beijing in 2009, Using Spoligotyping and VNTR Typing. PLoS ONE, 9 (9), e106787. doi: 10.1371/journal.pone.0106787
Roetzer, A., Schuback, S., Diel, R., Gasau, F., Ubben, T., di Nauta, A. et. al. (2011). Evaluation of Mycobacterium tuberculosis Typing Methods in a 4-Year Study in Schleswig-Holstein, Northern Germany. Journal of Clinical Microbiology, 49 (12), 4173–4178. doi: 10.1128/jcm.05293-11
Fitzgibbon, M. M., Gibbons, N., Roycroft, E. (2013). A snapshot of genetic lineages of Mycobacterium tuberculosis in Ireland over a two-year period, 2010 and 2011. Euro Surveill, 18 (3), 1–7.
Ojo, O. O., Sheehan, S., Corcoran, D. G., Nikolayevsky, V., Brown, T., O’Sullivan, M. et. al. (2010). Molecular epidemiology of Mycobacterium tuberculosis clinical isolates in Southwest Ireland. Infection, Genetics and Evolution, 10 (7), 1110–1116. doi: 10.1016/j.meegid.2010.07.008
Noguti, E. N., Leite, C. Q. F., Malaspina, A. C., Santos, A. C. B., Hirata, R. D. C., Hirata, M. H. et. al. (2010). Genotyping of Mycobacterium tuberculosis isolates from alow-endemic setting in northwestern state of Paraná in Southern Brazil. Mem. Inst. Oswaldo Cruz, 105 (6), 779–785. doi: 10.1590/s0074-02762010000600008
Rovina, N., Karabela, S., Constantoulakis, P., Michou, V., Konstantinou, K., Sgountzos, V. et. al. (2011). MIRU-VNTR typing of drug-resistant tuberculosis isolates in Greece. Therapeutic Advances in Respiratory Disease, 5 (4), 229–236. doi: 10.1177/1753465811402120
Rosales, S., Pineda-García, L., Ghebremichael, S., Rastogi, N., Hoffner, S. E. (2010). Molecular diversity of Mycobacterium tuberculosis isolates from patients with tuberculosis in Honduras. BMC Microbiology, 10 (1), 208. doi: 10.1186/1471-2180-10-208
Streicher, E. M., Warren, R. M., Kewley, C., Simpson, J., Rastogi, N., Sola, C. et. al. (2004). Genotypic and Phenotypic Characterization of Drug-Resistant Mycobacterium tuberculosis Isolates from Rural Districts of the Western Cape Province of South Africa. Journal of Clinical Microbiology, 42 (4), 1862–1862. doi: 10.1128/jcm.42.4.1862.2004
##submission.downloads##
Опубліковано
Номер
Розділ
Ліцензія
Авторське право (c) 2015 Александр Алексеевич Ляшенко
Ця робота ліцензується відповідно до Creative Commons Attribution 4.0 International License.
Наше видання використовує положення про авторські права Creative Commons CC BY для журналів відкритого доступу.
Автори, які публікуються у цьому журналі, погоджуються з наступними умовами:
1. Автори залишають за собою право на авторство своєї роботи та передають журналу право першої публікації цієї роботи на умовах ліцензії Creative Commons CC BY, котра дозволяє іншим особам вільно розповсюджувати опубліковану роботу з обов'язковим посиланням на авторів оригінальної роботи та першу публікацію роботи у цьому журналі.
2. Автори мають право укладати самостійні додаткові угоди щодо неексклюзивного розповсюдження роботи у тому вигляді, в якому вона була опублікована цим журналом (наприклад, розміщувати роботу в електронному сховищі установи або публікувати у складі монографії), за умови збереження посилання на першу публікацію роботи у цьому журналі.
