Балансова динамічна модель клітинного циклу

Автор(и)

  • Анатолий Иванович Божков НДІ біології Харківський національний університет імені В.Н.Каразіна пл.Свободи, 4, м.Харків, 61022, Україна
  • Надежда Дмитриевна Гернет Харківський національний університет імені В.Н.Каразіна пл.Свободы, 4, г.Харків, 61022, Україна

DOI:

https://doi.org/10.15587/1729-4061.2013.19190

Ключові слова:

жива клітина, математичне моделювання, балансова модель, клітинний цикл, динаміка розвитку клітини

Анотація

Припускається, що життєдіяльність клітини у процесі репродукції нової клітини забезпечується комплексом метаболічних процесів, що утворюють три активно взаємодіючих потоки: речовини, енергії, інформації. Розглядаються питання математичного моделювання клітинного циклу, що являє собою динамічну послідовність подій від одного розподілу клітини до другого. Пропонується балансова динамічна модель, на основі формальних  властивостей якої обговорюються закономірності циклічної динаміки клітини.

Біографії авторів

Анатолий Иванович Божков, НДІ біології Харківський національний університет імені В.Н.Каразіна пл.Свободи, 4, м.Харків, 61022

Доктор Біологічних наук, професор

Директор НДІ біології

Надежда Дмитриевна Гернет, Харківський національний університет імені В.Н.Каразіна пл.Свободы, 4, г.Харків, 61022

Старший науковий співробітник

НДІ біології

Посилання

  1. Гернет, Н. Д. Информационная технология комплексной оценки процессов старения биологических организмов. [Текст] / Н. Д. Гернет, А. И. Божков // Восточно-Европейский журнал передовых технологий. – 2012. – №6/2. – C. 31-36.
  2. Лахно, В. Д. Математическая клетка. Концепции построения математических моделей переноса заряда в живой клетке [Текст] / В. Д. Лахно // Вестник РУДН. Серия Прикладная и компьютерная математика. 2003. – Т.2, №2. – С. 77-84.
  3. Терентьев, А. А. Динамическая протеомика в моделировании живой клетки. Белок-белковые взаимодействия [Текст] / А. А. Терентьев, Н. Т. Молдогазиева, К. В. Шайтан // Успехи биологической химии. – 2009. – Т.49. – С. 429-480.
  4. Smolen, P. Mathematical modelinng of gene networks [Текст] / P. Smolen, D. A. Baxter, J. H. Byrne // Neuron. – 2000. – Vol. 26. – P. 567-580.
  5. Hasty, J. Computational studies of gene regulatory networks in numero molecular biology. [Текст] / J. Hasty, D. McMillen, F. Isaacs, J. J. Collins // Nature Rev. Genet. – 2001. – Vol.2. – P. 268-297.
  6. Ризниченко, Г. Ю. Лекции по математическим моделям в биологии / Г. Ю. Ризниченко. – М., Ижевск: НИЦ «Регулярная и хаотическая динамика», 2011. – 560 с.
  7. Кривовичев, Г. В. Математическое моделирование плоских движений живой клетки [Текст] / Г. В. Кривовичев, В. П. Трегубов // Вестник Харьковского национального университета им. В. Н. Каразина. – 2009. – №850. – С. 91-102.
  8. Zhu, C. Cell mechanics: mechanical response, cell adhesion and molecular deformation [Текст] / C. Zhu, G. Bao, N. Wang // Annual Reviews of Biomedical Engineering. – 2000. – Vol. 02. – Р. 189-226.
  9. Petelin, D. V. Simple Model of Cell Cycle Dynamics. [Текст] / D. V. Petelin, M. Sadovsky // Journal of Siberian Federal University. Mathematical & Physics. – 2011. – №4(3). – Р. 382-384.
  10. Лахно, В. Информационно-вычислительная среда Mathcell для моделирования живой клетки [Текст] / В. Лахно, Н. Назипова, В. Ким, С. Филиппов, Н. Фиалко, Д. Устинин, А. Теплухин, Г. Тюльбашева, А. Зайцев, М. Устинин // Математическая биология и биоинформатика. – 2007. – Т. 2, №2. – С. 361-376.
  11. Халявкин, А. В. Старение: роль управляющих сигналов [Текст] / А. В. Халявкин, А. И. Яшин; ред. Г. И. Марчук и др. // Геронтология in silico: Становление новой дисциплины. Математические модели, анализ данных и вычислительные эксперименты. – М.: БИНОМ. Лаборатория знаний, 2007. – С. 114-147.
  12. Згуровский, М. З. / Системный анализ. Проблемы. Методология. Приложения [Текст] / М. З. Згуровский, Н. Д. Панкратова. – К.: Наукова думка, 2005. – 741 с.
  13. Savagean, M. A. Biochemacal System Analysis. [Текст] / M. A. Savagean. – Addison Wesley, Reading., 1976.
  14. Doyle, F. J. Systems interface biology. [Текст] / F. J. Doyle, J. Stelling // J. R. Soc. Interface. – 2006. – №3. – Р. 603-616.
  15. Voit, E. O. Biochemical Systems Theory: A Rewieu. [Текст] / E. O. Voit // ISRN Biochemicals. – Volume 2013. – Article ID897758. – 53 p.
  16. Voit, E. O. Canonical Nonlinear Modelling. S-System Approach to Understanding Complexity [Текст] / E. O. Voit // Van Nostrand Reinhold. – New York, NY, USA, 1991.
  17. Ярыгин, В. Н. Биология [Текст] / В. Н. Ярыгин, В. И. Васильева, И. Н. Волков, В. В.Синельщикова. – М.: Высш.шк., 2003. – 432 с.
  18. Атауллаханов, Ф. И. Клетка: координация молекулярных процессов деления [Текст] / Ф. И. Атауллаханов., Е. Л. Грищук // Журнал «Природа» . – 2012. – №01. – С. 37-44.
  19. Калашников, Ю. Я. Информационный микромир живой клетки (идеи, концепции, гипотезы) [Электронный ресурс] / Ю. Я. Калашников // Библиотека РГИУ. Философия информационной цивилизации. – Режим доступа: www/ URL: http://www/sciteclibarary.ru/rus/catalog/pages/9557.html. – 11.03.2009г.
  20. Малинецкий, Г. Г. Математические основы синергетики. Хаос, структуры. Вычислительный эксперимент [Текст] / Г. Г. Малинецкий. – М.: КомКнига, 2005. – 312 с.
  21. Гантмахер, Ф. Р. Теория матриц [Текст] / Ф. Р. Гантмахер. – М:. Наука, 1988.
  22. Гернет, Н. Д. Прогнозирование динамики процессов старения биологических систем. [Текст]: материалы 13-й Междунар. междисциплинарной науч.-практ. школы-конф., 26 апреля – 05 мая 2013г. / Н. Д. Гернет, А. И. Божков // Современные проблемы науки и образования. – Харьков: Украинская Ассоциация “Женщины в науке и образовании“, Харьковский национальный университет имени В. Н. Каразина, 2013. – С.196-197.
  23. Gernet, N., Bozhkov, А. (2012). Informational technology for the complex estimation of the biological organism ageing processes. Eastern-European Journal of Enterprise Technologies, 6(2(60)), 31-36.
  24. Lakhno, V. (2003). Mathematical cell. Concepts of mathematical models creation of charge transfer in living cell. Messenger of RUDN. Series Applied and computer mathematics, V.2, №2, 77-84.
  25. Terentyev, A., Moldogaziyeva, N., Shaitan, K. (2009). Dynamic proteomika in living cell modeling. Protein-proteinaceous interactions. Successes of biological chemistry, 49, 429-480.
  26. Smolen, P., Baxter, D., Byrne, J. (2000). Mathematical modelinng of gene networks. Neuron, 26, 567-580.
  27. Hasty, J., McMillen, D., Isaacs, F., Collins, J. (2001). Computational studies of gene regulatory networks in numero molecular biology. Nature Rev. Genet, 2, 268-297.
  28. Riznichenko, G. (2011). Lectures on mathematical models in biology. M., Izhevsk: Research Center “Regular and chaotic dynamics”, 560.
  29. Krivovichev, G., Tregubov, V. (2009). Mathematical modeling of flat movements of living cell. The messenger of V.N. Karazin Kharkov national university, 850, 91-102.
  30. Zhu, C., Bao, G., Wang, N. (2000). Cell mechanics: mechanical response, cell adhesion and molecular deformation. Annual Reviews of Biomedical Engineering, 02, 189-226.
  31. Petelin, D., Sadovsky, M. (2011). Simple Model of Cell Cycle Dynamics. Journal of Siberian Federal University. Mathematical & Physics., 4(3), 382-384.
  32. Lakhno, V., Nazipov, N., Kim, V., Filippov, S., Fialko, N, Ustinin, D., Teplukhin, A., Tyulbasheva, G., Zaytsev, A., Ustinin, M. (2007). Information computing Mathcell environment for modeling of living cell. Mathematical biology and bioinformatics, Vol. 2, No. 2, 361-376.
  33. Halyavkin, A., Yashin, A.; In: Marchuk, G. I., etc. (2007). Aging: role of operating signals. “In silico” gerontology: Formation of new discipline. Mathematical models, analysis of data and computing experiments. M: BINOM. Laboratory of knowledge, 114-147.
  34. Zgurovsky, M., Pankratov, N. (2005). System analysis. Problems. Methodology. Appendices. Naukova thought, 741.
  35. Savagean, M. (1976). Biochemical System Analysis. Addison Wesley, Reading.
  36. Doyle, F. J., Stelling, J. (2006). Systems interface biology. J. R. Soc. Interface, 3, 603-616.
  37. Voit, E. O.(2003). Biochemical Systems Theory: A Rewieu. ISRN Biochemicals, Volume 2013, Article ID897758, 53.
  38. Voit, E. O. (1991). Canonical Nonlinear Modelling. S-System Approach to Understanding Complexity. Van Nostrand Reinhold. New York, NY, USA.
  39. Yarygin, V., Vasilyeva, V., Volkov, I., Sinelshchikova, V. (2003). Biology. M: Higher school, 432.
  40. Ataullakhanov, F., Grishchuk, E. (2012). Cell: coordination of molecular processes of division. “Priroda” magazine, 01, 37-44.
  41. Kalashnikov, Yu. (2009). Information microcosm of living cell (idea, concept, hypothesis). RGIU Library. Philosophy of information civilization. http://www/sciteclibarary.ru/rus/catalog/pages/9557.html.
  42. Malinetsky, G. G. (2005). Mathematical bases of synergetrics. Chaos, structures. Computing experiment. M: КомBook, 312.
  43. Gantmakher, F. R. (1988). The Theory of matrixes.
  44. Gernet, N., Bozhkov, A. (2013). Forecasting of aging processes dynamics of biological systems. Modern problems of science and education. Materials 13th International interdisciplinary scientific and practical conference, 196-197.

##submission.downloads##

Опубліковано

2013-12-16

Як цитувати

Божков, А. И., & Гернет, Н. Д. (2013). Балансова динамічна модель клітинного циклу. Eastern-European Journal of Enterprise Technologies, 6(4(66), 42–47. https://doi.org/10.15587/1729-4061.2013.19190

Номер

Том 6 № 4(66) (2013): Математика та кібернетика - прикладні аспекти

Розділ

Математика та кібернетика - прикладні аспекти

Ліцензія

Авторське право (c) 2014 Анатолий Иванович Божков, Надежда Дмитриевна Гернет

Creative Commons License

Ця робота ліцензується відповідно до Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Закріплення та умови передачі авторських прав (ідентифікація авторства) здійснюється у Ліцензійному договорі. Зокрема, автори залишають за собою право на авторство свого рукопису та передають журналу право першої публікації цієї роботи на умовах ліцензії Creative Commons CC BY. При цьому вони мають право укладати самостійно додаткові угоди, що стосуються неексклюзивного поширення роботи у тому вигляді, в якому вона була опублікована цим журналом, але за умови збереження посилання на першу публікацію статті в цьому журналі.

Ліцензійний договір – це документ, в якому автор гарантує, що володіє усіма авторськими правами на твір (рукопис, статтю, тощо).
Автори, підписуючи Ліцензійний договір з ПП «ТЕХНОЛОГІЧНИЙ ЦЕНТР», мають усі права на подальше використання свого твору за умови посилання на наше видання, в якому твір опублікований. Відповідно до умов Ліцензійного договору, Видавець ПП «ТЕХНОЛОГІЧНИЙ ЦЕНТР» не забирає ваші авторські права та отримує від авторів дозвіл на використання та розповсюдження публікації через світові наукові ресурси (власні електронні ресурси, наукометричні бази даних, репозитарії, бібліотеки тощо).
За відсутності підписаного Ліцензійного договору або за відсутністю вказаних в цьому договорі ідентифікаторів, що дають змогу ідентифікувати особу автора, редакція не має права працювати з рукописом.
Важливо пам’ятати, що існує і інший тип угоди між авторами та видавцями – коли авторські права передаються від авторів до видавця. В такому разі автори втрачають права власності на свій твір та не можуть його використовувати в будь-який спосіб.